O sobrado nº 7, que abriga o Museu Casa Histórica de Alcântara, foi construído no início do século XIX pelo comendador José Maria Correia de Souza, um imigrante português que enriqueceu no Brasil. Seus primeiros proprietários foram os Barões de São Bento, Francisco Mariano de Viveiros Sobrinho e sua esposa D. Mariana Francisca Correia de Souza, filha do Comendador.
Em 1889, o sobrado e parte do seu mobiliário foram vendidos aos Guimarães, comerciantes, que instalaram na área térrea do imóvel uma botica, uma loja de gêneros alimentícios, utilitários domésticos e agrícolas e uma loja de tecidos e armarinhos. Com o falecimento do patriarca da família, Sr. Antonino da Silva Guimarães em 1947, o comércio foi sendo, gradativamente, desativado pelos seus descendentes.
No ano de 1986, o imóvel e todo o mobiliário, pratarias, vidraria de farmácia, alfaias, peças de vestuário e demais objetos de valor histórico existentes foram desapropriados pelo Governo Federal através do decreto nº 93.656 de 05 de dezembro com a finalidade de instalar uma Casa de Época.
Em 1987 o imóvel passou para a guarda do IPHAN, e ao longo de dezoito anos foram realizadas diversas obras de intervenção, recuperação e adaptação para abrigar o museu, restauro e inventario do acervo e oficinas de capacitação ministradas pela museóloga Célia Cursino e pela Arquiteta Evelina Grumberg.
Com a missão de “Promover o patrimônio cultural da cidade de Alcântara aos visitantes e prestar serviços à sociedade alcantarense através de ações sócio/educativas promovendo a difusão do patrimônio cultural do município, contribuindo para o fortalecimento, valorização e proteção da identidade da população local” o Museu Casa Histórica de Alcântara inaugurou em junho de 2004 e iniciou suas atividades ao público em novembro do mesmo ano.
A partir de janeiro de 2007, através da Portaria nº 43 o Museu passa para a gestão administrativa, financeira e patrimonial do Departamento de Museus e Centros Cultural – DEMU/IPHAN e em janeiro de 2009 para a esfera do Instituto Brasileiro de Museus.